经过多次测试发现，造成这种情况的原因是我使用PowerCMD启动MongoDB之后直接关掉PowerCMD窗口之后造成的，如果在关闭PowerCMD窗口之前使用 [ctrl + c] 快捷键终止mongod的运行也不会出现此种情况。而且，使用普通的CMD窗口运行mongo命令即使直接关掉窗口也不会出现该问题，看来还是使用原生程序更靠谱。
发生了此种情况解决方法也很简单，使用如下参数repair即可：
然后重新启动即可：
还有一些情况会造成这种 Unclean shutdown，解决方法可参考官方文档：
http://www.mongodb.org/display/DOCS/Durability+and+Repair
